國家稅務總局擬在部分行業試點農產品增值稅進項稅額核定扣除，統一進項稅抵扣率和銷項稅征收率。此舉將大大減輕農產品加工企業的增值稅負擔。
在一份《關于部分行業試行農產品增值稅進項稅額核定扣除管理辦法的公告》（征求意見稿）中，國稅總局明確，將在液體乳及乳制品制造和食用植物油加工行業率先試點進項稅額核定扣除辦法，同時將農產品進項稅額扣除率由現行的13%修改為納稅人再銷售時貨物的適用稅率，即納稅人銷售的貨物適用13%稅率的，則扣除率為13%，納稅人銷售的貨物適用17%稅率的，則扣除率為17%。
“進項稅抵扣”是增值稅的一大特點，企業應繳的增值稅實際上是銷項稅減去進項稅抵扣后的部分。銷項稅是指銷售貨物時應繳納的稅金，進項稅則是購進貨物時所發生的稅金。但由于銷項稅和進項稅稅率的不統一，農產品加工企業增值稅稅負實際上比工業企業還高。
據了解，目前，我國的農產品初加工企業主要原材料的購進普遍按13%的扣除率進行進項稅抵扣，但在銷售產品時則按17%的增值稅率征收銷項稅，“高征低扣”使農產品加工企業多承受了4%的增值稅稅負，而普通工業企業是征17%抵扣17%,，這顯然對農產品加工企業不盡公平。為此，農業領域人士一直呼吁將進銷項稅率統一。
征求意見稿指出，將進項稅扣除率調整為產成品的適用稅率，可以大大減輕農產品加工企業的增值稅負擔，有利于鼓勵農產品加工增值，提高國際競爭力，促進農產品加工行業的發展。
雖然征求意見稿并未明確試點的具體時間，但據了解，在液體乳及乳制品制造和食用植物油加工兩個行業試點之后，國稅總局將按照先易后難的原則逐步推開這一新政策。